A metà del XVIII secolo il comune era direttamente sottoposto alla giurisdizione del podestà di Milano presso la banca criminale il console, tutore dell'ordine pubblico, era tenuto a prestare l'annuale giuramento (Risposte ai 45 quesiti, 1751; cart. 3023 e 3025).
Nel compartimento territoriale dello stato di Milano (editto 10 giugno 1757) il comune di Bestazzo risulta inserito nella pieve di Corbetta, compresa nel ducato di Milano.
Nel 1771 Bestazzo contava 496 abitanti (Statistica anime Lombardia, 1771).
Con il successivo compartimento territoriale della Lombardia austriaca (editto 26 settembre 1786 c) il comune, sempre compreso nella pieve di Corbetta, venne trasportato nella provincia di Pavia, delegazione XVI.
In forza del nuovo compartimento territoriale per l'anno 1791, il comune di Bestazzo rimase nella pieve di Corbetta, incluso nel XXIV "distretto censuario" della provincia di Milano (Compartimento Lombardia, 1791).
Con la legge 20 marzo 1798 di organizzazione del dipartimento del Ticino (legge 30 ventoso anno VI) il comune di Bestazzo venne inserito nel distretto di Corbetta.
Soppresso il dipartimento del Ticino (legge 15 fruttidoro anno VI a), in seguito alla successiva legge 26 settembre 1798 di ripartizione territoriale dei dipartimenti d'Olona, Alto Po, Serio e Mincio (legge 5 vendemmiale anno VII), Bestazzo fu trasportato nel dipartimento d'Olona, distretto di Abbiategrasso.
Con la legge 13 maggio 1801 di ripartizione territoriale della Repubblica Cisalpina (legge 23 fiorile anno IX) il comune di Bestazzo, cui risulta unito San Pietro Bestazzo, venne incluso nel distretto IV del dipartimento d'Olona, con capoluogo Gallarate.
Nel compartimento territoriale del Regno d'Italia (decreto 8 giugno 1805 a) il comune di Bestazzo appare nuovamente privo della frazione San Pietro Bestazzo, tornata ad essere comune autonomo. Designato comune di III classe, con una popolazione di 273 abitanti, Bestazzo rimase a far parte del dipartimento d'Olona, inserito nel distretto II di Pavia, cantone III di Abbiategrasso.
In seguito al decreto di aggregazione e unione dei comuni del dipartimento d'Olona (decreto 4 novembre 1809 a) il comune di Bestazzo venne soppresso e aggregato al comune di Cisliano, anch'esso compreso nel cantone III del distretto II di Pavia.
Con il successivo decreto di concentrazione e unione dei comuni del dipartimento d'Olona (decreto 8 novembre 1811) anche il comune di Cisliano fu soppresso e, con gli uniti Bestazzo e San Pietro Bestazzo, aggregato al comune di Cusago, incluso nel cantone I del distretto I di Milano.
Con il compartimento territoriale delle province lombarde del regno Lombardo-Veneto (notificazione 12 febbraio 1816) il ricostituito comune di Bestazzo venne inserito nella provincia di Pavia, distretto VIII di Abbiategrasso.
Il comune, che aveva convocato generale, rimase nel distretto VIII di Abbiategrasso anche in seguito al successivo compartimento territoriale delle province lombarde (notificazione 1 luglio 1844).
Nel compartimento territoriale della Lombardia (notificazione 23 giugno 1853) Bestazzo risulta ancora compreso nella provincia di Pavia, distretto V di Abbiategrasso. La sua popolazione era formata da 446 abitanti.
In seguito all'unione temporanea delle province lombarde al regno di Sardegna, in base al compartimento territoriale stabilito con la legge 23 ottobre 1859, il comune di Bestazzo con 471 abitanti, retto da un consiglio di quindici membri e da una giunta di due membri, fu incluso nel mandamento I di Abbiategrasso, circondario V di Abbiategrasso, provincia di Milano.
Alla costituzione nel 1861 del Regno d'Italia, il comune aveva una popolazione residente di 412 abitanti (Censimento 1861). In base alla legge sull'ordinamento comunale del 1865 il comune veniva amministrato da un sindaco, da una giunta e da un consiglio. Nel 1867 il comune risultava incluso nello stesso mandamento, circondario e provincia (Circoscrizione amministrativa 1867). Nel 1870 il comune di Bestazzo venne aggregato al comune di Cisliano (R.D. 9 giugno 1870, n. 5722).

(Profilo compilato sulla base di: "Le istituzioni storiche del territorio lombardo. XIV - XIX secolo. Milano - la provincia", Progetto CIVITA, Regione Lombardia, Milano, 1999, repertoriazione a cura di Giorgio Sassi, Katia Visconti; "Le istituzioni storiche del territorio lombardo. 1859 - 1971", 2 voll., Progetto CIVITA, Regione Lombardia, Milano, 2001, repertoriazione a cura di Fulvio Calia, Caterina Antonioni, Simona Tarozzi)