La restituzione del castrum alla Mensa, ad opera di Carlo d'Angiò nel 1266, lasciò comunque irrisolto il problema della proprietà in oggetto; successivamente il re Ladislao tolse Bitritto alla Chiesa di Bari e nel 1404, il re Ferrante restituì Bitritto alla Mensa arcivescovile di Bari con il titolo di baronia insieme alla giurisdizione civile e criminale.
Nel periodo fra XVI e XVII secolo il paese appare dominato dalle figure vescovili e dal clima della Controriforma tridentina: all'erezione della Chiesa Matrice, dedicata alla Madonna di Costantinopoli e legata alla fine dell'epidemia di peste, seguono l'istituzione di confraternite laicali e la costruzione di nuove chiese.
Alla fine del Settecento, la nuova classe sociale borghese si scontrava con il potere feudale vescovile, per cui l'Universitas si pose per la prima volta come soggetto autonomo nei confronti della Mensa Arcivescovile di Bari. I rapporti della cittadinanza con l'arcivescovo di Bari, barone del feudo di Bitritto, iniziarono ad allentarsi. Il 30 novembre 1794, l'Universitas accettò - con la stipula di un pubblico e solenne documento - di assumersi in proprio il carico della giurisdizione della mastrodattia - privilegio consistente nel gestire gli atti pubblici - sottraendola all'Arcivescovo che d'altra parte aveva già chiesto di rinunciarvi. Nell'anno successivo il governatore della locale corte produsse istanza affinché la terra di Bitritto divenisse demaniale e chiese "la grazia di essere quel luogo dichiarato città, con incorporarsi al demanio".
Nel decennio napoleonico (1806-1815) la legge dell'abolizione del feudalesimo del 2 agosto 1806, unitamente all'emanazione di altre disposizioni antifeudali, eliminò i diritti feudali dei baroni, e il comune cominciò a darsi precise regole con l'istituzione degli Statuti municipali. A seguito del riassetto amministrativo delle province napoletane, infatti, determinato dal regio decreto n. 922 del 4 maggio 1811, la Provincia di Terra di Bari fu divisa in tre distretti: Bari, Barletta e Altamura.
Comune della provincia di Terra di Bari, nel distretto di Bari, ai sensi della legge 8 dicembre 1806, n. 272 "che determina i distretti del regno", fa parte del circondario di Modugno, in attuazione del decreto 4 maggio 1811, n. 922 "per la nuova circoscrizionedelle quattordici province del regno di Napoli".
Alla vigilia della proclamazione del Regno d'Italia, nel febbraio 1861, la fine imminente del potere arcivescovile baronale a Bitritto fu segnata da un evento clamoroso: la devastazione di terreni appartenenti alla curia da parte di numerosi cittadini. Nel 1866, infine, in base alle leggi eversive del 21 agosto 1862, 7 luglio 1866 e 15 agosto 1867, anche la Mensa arcivescovile di Bari, cui Bitritto ancora apparteneva in "baronia" di fatto, dovette cedere di fronte all'incalzare di tali normative. Fu solo allora che i vescovi baresi cessarono completamente di essere baroni di Bitritto. Contemporaneamente, venne disconosciuto anche il titolo della proprietà ecclesiastica di beni immobili situati nel territorio di Bitritto, beni che furono confiscati e incamerati nel demanio del nuovo stato italiano. La possessione feudale di Bitritto, dunque, che aveva avuto origine nell'XI secolo con l'arcivescovo di Bari Andrea II, potè dirsi definitivamente conclusa solo nel 1866, con l'arcivescovo Francesco Pedicini, ultimo "barone de facto".
(S. Franchini)